آرمان ما ایجاد مجموعه‌ای خلاق و پیشرو در زمینه پژوهش‌های بالینی و ارتقای سلامت و بهداشت است که بنا دارد با تولید دانش و فناوری تحقیقات در جهت افزایش آگاهی و حفظ ارتقای سطح سلامت جامعه در حد استانداردهای جهانی و اصلاح آن استانداردها در حد بضاعت خویش گام بردارد.
ما بر آنیم که با تکیه بر توانمندی‌های خویش و بهره گیری از تجارب دیگران، موجبات حضور برتر علمی پژوهشی دانشگاه را در سطح قابل قبول فراهم آوریم و به لطف الهی دست یابی به اهداف چشم انداز علمی کشور را تزکیه کنیم.
ما مصمم هستیم تا با توجه به موقعیت و چهره کشورمان در منطقه و ویژگی‌های خاص استان قم بطور خاص ضمن حفظ کرامت انسانی و رعایت قوانین و مقررات و ارزش های والای اسلامی با ترغیب و تشویق و ایجاد روحیه نوآوری در دانشگاه و توجه ویژه به استعدادهای دانشگاه بستر مناسبی را برای ارتقاء ظرفیت‌های پژوهشی و افزایش سطح کیفی و کمی آنها و بکارگیری نتایج تحقیقات کاربردی و بنیادی با تأکید بر پژوهش های بالینی فراهم آوریم.
ما بنا داریم با تجهیز این واحد به آخرین فناوری اطلاع رسانی و استانداردهای مناسب در ترویج و بهبود کیفی فعالیت‌های پژوهشی بکوشیم.
ما مصمم هستیم طرح‌های تحقیقاتی مفید و کاربردی را در اسرع وقت تحت حمایت‌های همه جانبه خود تا رسیدن به نتیجه مطلوب قرار دهیم.
به منظور دستیابی به مأموریت فوق و با توجه به ظرفیت‌های پژوهشی دانشگاه، اهداف کلان این واحد به این شرح تدویــن می‌گردد:
هدفمند نمودن پژوهش‌های بنیادی و کاربردی با لحاظ نمودن اخلاق در پژوهش و بهینه‌سازی استفاده از بودجه‌های قابل استفاده در بخش تحقیقات به منظور بهبود کیفی و کمی پژوهش و حمایت از پژوهشگران
توانمند سازی پژوهشگران و توسعه تحقیقات کاربردی و بهره‌گیری از نتایج آنها در جهت حل مشکلات و ارتقاء سلامت جامعه و تهیه دستورالعمل‌های بومی و ...
بسط و توسعه ارتباطات و همکاری‌های منطقه‌ای، ملی و جهانی از طریق عقد قراردادها، تفاهم نامه‌ها و اجرای پروژه‌های مشترک و کارهای گروهی
کمک و بسترسازی در ایجاد پژوهشکده‌ها و مراکز تحقیقاتی بالینی
توسعه پژوهش های ملی و کاربردی با تأکید بر پژوهش‌های بالینی
حمایت همه جانبه از پژوهشگران و محققین علوم بالینی
توانمندسازی پژوهشگران در امور پژوهش
توسعه زیربنای ارتباطی و توسعه همکاری‌های فی ما بین مراکز پژوهشی کشور
توسعه پژوهش های ملی و کاربردی با تأکید برپژوهشهای بالینی
حمایت همه جانبهازپژوهشگران و محققین علوم بالینی
توانمندسازی پژوهشگران در امورپژوهش
توسعه زیربنای ارتباطی و توسعه همکاری‌های فی ما بین مراکزپژوهشی کشور
